Shinji se po čtrnácti letech od třetího impaktu dostáva z Unit-01 a zjišťuje, že se změnil nejen svět, ale i lidé, které znal. Jeho nový známý Kawora mu vysvětlí situaci, o které všichni ostatní mlčeli. Když si Shinji uvědomí, že třetí impakt vznikl jeho zásluhou, společně se pokusí vzniklé škody napravit. Ne vždy však jde vše podle plánu...
